作为异于人类的变种生物,师父斯普林特和忍者神龟组成的“龟鼠家庭”一直在下水道过着隐姓埋名的生活。然而四小只却一直向往着外面的世界。当他们得知神秘反派超级苍蝇为非作歹、祸乱城市时,战胜邪恶、主持正义,进而被人类社会接纳的想法油然而生。当他们历尽艰辛,终于追踪到超级苍蝇时,却发现他及其手下同样也是变种生物。不过,遇到同类的喜悦很快被超级苍蝇想要毁灭人类世界的阴谋冲散。面对来势汹汹意欲统治地球的变种大军,四小神龟勇敢迎敌,一场翻天覆地的正邪较量即将上演!虽然如此,但这并不意味着本片是粗制滥造的,恰恰相反,本片将自己的最大的能力全部集中在了应该集中的地方,比如说动作设计,比如说火爆场面。虽然马队长的功能性是单一的,但是对于他来说,这些单一的武力够用就行。就跟陈咬金的三板斧是一样的,看似简单,实际上大多数情况下所向无敌,一旦有了敌人,马队长稍微加一些力也能将敌人彻底击溃。