该片讲述忍者神龟四兄弟远离人类世界多年之后,决定主动出击,希望能够靠着他们的英勇事迹赢得纽约客的心,并且获得他们的接纳,成为正常的青少年。他们的新朋友艾波欧尼尔也协助他们试图扳倒一个神秘的犯罪集团,但是当对方派出一支变种军团,他们很快就发现他们根本就是自不量力……《超级马里奥兄弟大电影》的导演Aaron Horvath在接受《Variety》采访时谈到了这一点。该团队提出了“floatanium”这个术语,据称是这种蘑菇王国特有的矿物质使砖块漂浮在空中。这种在蘑菇王国出产的天然矿物质,有奇诺比奥们进行开采,用户各种建筑。